该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅PGPC。
生物导体版本:3.8
该软件包包含实验数据和通过分析等源性HCT116细胞系中化学基因相互作用筛选的实验数据和插图指导。该代码可以执行以生成手稿的所有结果和数字“使用癌细胞中的高通量成像的小分子的化学遗传相互作用图”在分子系统生物学上接受了Pububilaton。数据可用性:该数据集的互补视图可通过不同的存储库获得。该图像数据文件可从欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)的生物固定数据库获得S-BSMS-PGPC1(http://wwwwdev.ebi.ac.ac.uk/biostudies/studies/studies/s-bbsms-pgpc11))IDR数据库http://dx.doi.org/10.17867/10000101提供了用于探索图像的交互式前端。作者正在托管一个交互式网页,以http://dedomena.embl.de/pgpc浏览图像和交互配置文件。
作者:Felix Klein
维护者:felix klein
引用(从r内,输入引用(“ PGPC”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pgpc”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 |
生物浏览 | 癌症,,,,Coloncancerdata,,,,实验数据 |
版本 | 1.10.0 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.0),ebimage,,,,ImageHts,,,,搜索者,,,,林玛,,,,rcolorbrewer,,,,GPLOTS,,,,斑点,,,,GGPLOT2,,,,Geneplotter,,,,化学机器,,,,RESHAPE2,,,,plyr |
进口 | |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pgpc |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/pgpc |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/pgpc/ |
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