PGPC

doi:10.18129/b9.bioc.pgpc

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅PGPC

实验数据和等源性HCT116细胞系中化学遗传相互作用筛选的分析

生物导体版本:3.8

该软件包包含实验数据和通过分析等源性HCT116细胞系中化学基因相互作用筛选的实验数据和插图指导。该代码可以执行以生成手稿的所有结果和数字“使用癌细胞中的高通量成像的小分子的化学遗传相互作用图”在分子系统生物学上接受了Pububilaton。数据可用性:该数据集的互补视图可通过不同的存储库获得。该图像数据文件可从欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)的生物固定数据库获得S-BSMS-PGPC1(http://wwwwdev.ebi.ac.ac.uk/biostudies/studies/studies/s-bbsms-pgpc11))IDR数据库http://dx.doi.org/10.17867/10000101提供了用于探索图像的交互式前端。作者正在托管一个交互式网页,以http://dedomena.embl.de/pgpc浏览图像和交互配置文件。

作者:Felix Klein

维护者:felix klein

引用(从r内,输入引用(“ PGPC”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pgpc”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

PDF 参考手册

细节

生物浏览 癌症,,,,Coloncancerdata,,,,实验数据
版本 1.10.0
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.0),ebimage,,,,ImageHts,,,,搜索者,,,,林玛,,,,rcolorbrewer,,,,GPLOTS,,,,斑点,,,,GGPLOT2,,,,Geneplotter,,,,化学机器,,,,RESHAPE2,,,,plyr
进口
链接
建议 生物使用,,,,尼特
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pgpc
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/pgpc
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/pgpc/
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