该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅seqc。
生物导体版本:3.8
SEQC/MAQC-III联盟已生产基准RNA-SEQ数据,用于评估RNA测序技术和数据分析方法(NAT Biotechnol,2014年)。从十个不同的测序位点生成了数十亿个序列读取。该软件包包含〜2000测序库的汇总读数数据。它还包括从研究中发现的所有外显子连接处。该软件包中还包括了〜1000个基因和ERCC Spike-In序列数据的TAQMAN RT-PCR数据。
作者:Yang Liao和Wei Shi在Gordon K Smyth和Steve Lianoglou的贡献中得到了贡献。
维护者:yang liao
引用(从r内,输入引用(“ SEQC”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ seqc”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ seqc”)
R脚本 | SEQC小插图 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 实验数据,,,,rnaseqdata,,,,序列数据,,,,qpcrdata |
版本 | 1.16.0 |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 2.10) |
进口 | utils,生物酶 |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | //www.andersvercelli.com/packages/release/data/experiment/html/seqc.html |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | seqc_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqc |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/seqc |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/seqc/ |
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