seqc

doi:10.18129/b9.bioc.seqc

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅seqc

由SEQC(MAQC-III)研究生成的RNA-seq数据

生物导体版本:3.8

SEQC/MAQC-III联盟已生产基准RNA-SEQ数据,用于评估RNA测序技术和数据分析方法(NAT Biotechnol,2014年)。从十个不同的测序位点生成了数十亿个序列读取。该软件包包含〜2000测序库的汇总读数数据。它还包括从研究中发现的所有外显子连接处。该软件包中还包括了〜1000个基因和ERCC Spike-In序列数据的TAQMAN RT-PCR数据。

作者:Yang Liao和Wei Shi在Gordon K Smyth和Steve Lianoglou的贡献中得到了贡献。

维护者:yang liao 和wei shi

引用(从r内,输入引用(“ SEQC”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ seqc”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ seqc”)

PDF R脚本 SEQC小插图
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 实验数据,,,,rnaseqdata,,,,序列数据,,,,qpcrdata
版本 1.16.0
执照 GPL-3
要看 R(> = 2.10)
进口 utils,生物酶
链接
建议
系统要求
增强
URL //www.andersvercelli.com/packages/release/data/experiment/html/seqc.html
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 seqc_1.16.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqc
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/seqc
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/seqc/
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