SystemPiperData
doi：10.18129/b9.bioc.systempiperdata
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅SystemPiperData。
SystemPiperData：NGS工作流模板和示例数据
生物导体版本：3.8
SystemPiperData是一个辅助软件包，可以使用单个命令NGS Workflow模板生成，该模板旨在由其父封装Systempiper使用。后者是一个用于构建端到端分析管道的环境，其下一代序列（NGS）应用程序（例如RNA-Seq，Ribo-Seq，Chip-Seq，chip-Seq，var-Seq等）的自动报告生成。使用SystemPiperData的详细示例在SystemPiper的概述Vignette中给出。
作者：托马斯·吉尔克（Thomas Girke）
维护者：thomas girke
引用（从r内，输入引用（“ SystemPiperData”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ systempiperdata”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
BrowseVignettes（“ SystemPiperData”）
| html | R脚本 | 概述小插图 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 读书我 | |
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 结盟，，，，chipseq，，，，覆盖范围，，，，DataImport，，，，实验数据，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，遗传学，，，，基础设施，，，，甲基，，，，QualityControl，，，，rnaseq，，，，SNP，，，，测序 |
| 版本 | 1.10.0 |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | 方法 |
| 进口 | 生物基因 |
| 链接 | |
| 建议 | 运行，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，Systempiper |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/tgirke/systempiperdata |
| 取决于我 | |
| 进口我 | rnaseqr |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | SystemPiperData_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/systempiperdata |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/systempiperdata |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/systempiperdata/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
