rnaseqgeneedgerql
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅rnaseqgeneedgerql。
基因级RNA-SEQ差异表达和途径分析使用RSUBREAD和EDGER准型管道
生物导体版本：3.8
通过其Vignette，该工作流程包提供了使用RSUBREAD和EDGER软件包对RNA-Seq实验进行完整的案例研究分析。工作流程从读取对齐开始，一直持续到数据探索，到差异表达，最后是途径分析。该分析包括出版质量图，GO和KEGG分析，以及对先前实验产生的表达签名的分析。
作者：Yunshun Chen，Aaron Lun，Gordon Smyth
维护者：yunshun chen
引用（从r内，输入引用（“ rnaseqgeneedgerql”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ rnaseqgeneedgerql”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ rnaseqgeneedgerql”）
| html | R脚本 | 从读取到基因再到途径：使用RSUBREAD和EDGER QUASI-LIKELIOHION PIPELINE对RNA-SEQ实验的差异表达分析 |
细节
| 生物浏览 | geneexpressionworkflow，，，，Immunooncologyworkflow，，，，工作流程 |
| 版本 | 1.4.1 |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 3.3.0），EDGER，，，，GPLOTS，，，，org.mm.eg.db，，，，go.db |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，编织 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://f1000research.com/articles/5-1438 |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | rnaseqgeneedgerql_1.4.1.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaseqgeneedgerql |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/rnaseqgeneedgerql |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/rnaseqgeneedgerql/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
