ASpli

DOI:10.18129 / B9.bioc.ASpli

这个包是3.9版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见ASpli。

利用RNA-Seq分析选择性剪接

Bioconductor版本:3.9

利用RNAseq分析选择性剪接的整合管道。

作者:埃斯特法尼娅·曼奇尼，哈维尔·伊塞尔特，马塞洛·扬诺夫斯基，阿里尔·切尔诺莫雷茨

维修工:埃斯特法尼亚·曼奇尼(Estefania Mancini)

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ASpli")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“ASpli”)

PDF	R脚本	用ASpli分析备选剪接
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，AlternativeSplicing，报道，DifferentialExpression，DifferentialSplicing，GeneExpression，GenomeAnnotation，ImmunoOncology，RNASeq，测序，软件，TimeCourse，转录
版本	1.10.0
在Bioconductor中	BioC 3.4 (R-3.3)(3年)
许可证	GPL
取决于	方法，grDevices, stats, utils, parallel，刨边机
进口	GenomicRanges，GenomicFeatures，BiocGenerics，IRanges，GenomicAlignments，Gviz，S4Vectors，AnnotationDbi，Rsamtools，BiocStyle
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	ASpli_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	ASpli_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ASpli_1.10.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/ASpli
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/ASpli
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ASpli/
软件包下载报告	下载数据