萤石

DOI:10.18129 / B9.bioc.CAnD

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅萤石

执行染色体血统的差异(萤石)分析

Bioconductor版本:3.9

函数执行萤石测试一组祖先比例。为特定的祖先的族群,用户将提供为每个样本比例估计血统,和感兴趣的每个染色体或染色体片段。每个染色体的假定值以及一个总体萤石假定值为每个测试将被返回。绘图函数也可以。

作者:凯特琳麦克休,蒂莫西•桑顿

维护人员:凯特琳麦克休< mchughc uw.edu >

从内部引用(R,回车引用(“萤石”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“萤石”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“萤石”)

PDF R脚本 检测异质性在染色体种群结构与“萤石”包
PDF 参考手册

细节

biocViews GeneticVariability,遗传学,单核苷酸多态性,软件,StatisticalMethod
版本 1.16.0
Bioconductor自 BioC 3.1 (r - 3.2)(4.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于
进口 方法,ggplot2,重塑
链接
建议 RUnit,BiocGenerics,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包 CAnD_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 CAnD_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) CAnD_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CAnD
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/萤石
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/CAnD/
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