CGHcall

DOI:10.18129 / B9.bioc.CGHcall

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见CGHcall．

调用阵列CGH肿瘤剖面畸变。

Bioconductor版本:3.9

使用六态混合模型和一些被现有算法忽略的生物学概念调用阵列CGH数据的像差。还提供了概要文件的可视化。

作者:Mark van de Wiel, Sjoerd Vosse

维护者:Mark van de Wiel < Mark。Vdwiel at vumc.nl>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CGHcall")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CGHcall”)

PDF	R脚本	CGHcall
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，预处理，软件，可视化
版本	2.46.0
在Bioconductor	BioC 2.1 (R-2.6)(12年)
许可证	GPL (http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html)
取决于	R (>= 2.0.0)，嫁祸于(> = 1.8.0),DNAcopy(>= 1.6.0)，方法Biobase，CGHbase(> = 1.15.1),降雪
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	CGHnormaliter，focalCall，GeneBreak
进口我	CGHnormaliter，QDNAseq
建议我	sigaR
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	CGHcall_2.46.0.tar.gz
Windows二进制	CGHcall_2.46.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CGHcall_2.46.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CGHcall
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CGHcall
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CGHcall/
软件包下载报告	下载数据