类别

DOI:10.18129 / B9.bioc.Category

此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本,请参见类别

类别分析

Bioconductor版本:3.9

用于进行分类(基因集富集)分析的工具集合。

作者:Robert Gentleman [aut], Seth Falcon [ctb], Deepayan Sarkar [ctb], Robert Castelo [ctb], Bioconductor Package Maintainer [cre]

维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者

引用(从R中,输入引用(“类别”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“类别”)

PDF R脚本 使用分类分析微阵列数据
PDF R脚本 用染色体带作为分类
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释GeneSetEnrichment通路软件
版本 2.50.0
Bioconductor自 BioC 1.6 (R-2.1)或更早的版本(> 14.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 方法、stats4BiocGenericsAnnotationDbiBiobase矩阵
进口 跑龙套,统计数据,RBGLGSEABasegenefilter注释DBI
链接
建议 EBarrays所有RgraphvizRColorBrewerxtable(> = 1.4 6),hgu95av2.dbKEGG.dbSNPchipgeneplotterlimma晶格RUnitorg.Sc.sgd.dbGOstatsGO.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 GOstatsPCpheno
进口我 categoryComparecellHTS2eisagCMAPinteractiveDisplaymeshrmiRLABPCphenophenoTestppiStatsRDAVIDWebServiceReportingToolsscTensor
建议我 BiocCaseStudiesGSEAlmMmPalateMiRNAqpgraphRnBeads
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 Category_2.50.0.tar.gz
Windows二进制 Category_2.50.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) Category_2.50.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Category
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/类别
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/Category/
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