该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅clumsid。
生物导体版本:3.9
Clumsid是一种工具,可通过使用MS2光谱相似性和无监督的统计方法来帮助鉴定非目标LC-MS/MS分析中的特征。它提供功能,可提供从原始数据到可视化的完整和可定制的工作流程,并且与XMCS家族的预处理软件包可以插入。
作者:Tobias Depke [AUT,CRE],Raimo Franke [CTB],Mark Broenstrup [Ths]
维护者:tobias depke
引用(从r内,输入引用(“ clumsid”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ clumsid”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Clumsid”)
html | R脚本 | clumsid di-ms/ms教程 |
html | R脚本 | Clumsid GC-EI-MS教程 |
html | R脚本 | Clumsid Lowres教程 |
html | R脚本 | Clumsid mtbls教程 |
html | R脚本 | Clumsid教程 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 聚类,,,,代谢组学,,,,预处理,,,,软件 |
版本 | 1.0.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.9(R-3.6)(<6个月) |
执照 | 麻省理工学院 +文件许可证 |
要看 | R(> = 3.6) |
进口 | MZR,,,,S4VECTORS,,,,dbscan,,,,rcolorbrewer,,,,猿,,,,网络,,,,ggally,,,,GGPLOT2,,,,情节,方法,utils,stats,sna,grdevices,图形,生物酶,,,,GPLOTS,,,,MSNBase |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,dplyr,,,,readr,,,,Stringr,,,,马格里特,,,,clumsiddata,,,,metams,,,,metamsdata,,,,XCMS |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/tdepke/clumsid |
BugReports | https://github.com/tdepke/clumsid/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | clumsid_1.0.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | clumsid_1.0.0.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | clumsid_1.0.0.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/clumsid |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/clumsid |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/clumsid/ |
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