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DBChIP
DOI:10.18129 / B9.bioc.DBChIP
这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DBChIP。
微分绑定ChIP-seq的转录因子
Bioconductor版本:3.9
DBChIP检测不同绑定锋利的结合位点在多个条件,有或没有匹配控制样本。
作者:库恩梁
维护人员:库恩梁< kliang stat.wisc.edu >
从内部引用(R,回车引用(“DBChIP”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DBChIP”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“DBChIP”)
| R脚本 | DBChIP | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | ChIPSeq,遗传学,测序,软件,转录 |
| 版本 | 1.28.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.11 (r - 2.15)(7年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 2.15.0),刨边机,DESeq |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | ShortRead,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | metagene,metagene2 |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | DBChIP_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | DBChIP_1.28.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | DBChIP_1.28.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DBChIP |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DBChIP |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/DBChIP/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
