该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅DESCAN2。
生物导体版本:3.9
集成峰和差分呼叫者,专为广泛的表观基因组信号而设计。
作者:Dario Righelli [AUT,CRE],John Koberstein [AUT],Bruce Gomes [aut],Nancy Zhang [aut],Claudia Angelini [aut],Lucia Peixoto [aut],Davide Risso [aut]
维护者:dario righelli
引用(从r内,输入引用(“ DESCAN2”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ descan2”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Descan2”)
html | R脚本 | DESCAN2小插图 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 覆盖范围,,,,表观遗传学,,,,免疫学,,,,峰值探测,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.4.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.7(R-3.5)(1。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.5),基因组机 |
进口 | 生物比较,,,,生物基因,,,,Chippeakanno,,,,Data.Table,,,,延迟,,,,GenomeInfodB,,,,基因组签名,,,,胶水,,,,iranges,,,,plyr,,,,RCPP(> = 0.12.13),rtracklayer,,,,S4VECTORS,,,,总结性特征,工具,UTILS |
链接 | RCPP,,,,rcpparmadillo |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,EDGER,,,,林玛,,,,EDASEQ,,,,Ruvseq,,,,rcolorbrewer,,,,Statmod |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | descan2_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | descan2_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | DESCAN2_1.4.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/descan2 |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/descan2 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/descan2/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |