DESCAN2

doi:10.18129/b9.bioc.descan2

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅DESCAN2

差分富集扫描2

生物导体版本:3.9

集成峰和差分呼叫者,专为广泛的表观基因组信号而设计。

作者:Dario Righelli [AUT,CRE],John Koberstein [AUT],Bruce Gomes [aut],Nancy Zhang [aut],Claudia Angelini [aut],Lucia Peixoto [aut],Davide Risso [aut]

维护者:dario righelli

引用(从r内,输入引用(“ DESCAN2”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ descan2”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Descan2”)

html R脚本 DESCAN2小插图
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,表观遗传学,,,,免疫学,,,,峰值探测,,,,测序,,,,软件
版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(1。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.5),基因组机
进口 生物比较,,,,生物基因,,,,Chippeakanno,,,,Data.Table,,,,延迟,,,,GenomeInfodB,,,,基因组签名,,,,胶水,,,,iranges,,,,plyr,,,,RCPP(> = 0.12.13),rtracklayer,,,,S4VECTORS,,,,总结性特征,工具,UTILS
链接 RCPP,,,,rcpparmadillo
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,EDGER,,,,林玛,,,,EDASEQ,,,,Ruvseq,,,,rcolorbrewer,,,,Statmod
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 descan2_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 descan2_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) DESCAN2_1.4.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/descan2
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/descan2
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/descan2/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户