这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见DelayedArray.
Bioconductor版本:3.9
将类似数组的对象(通常是磁盘上的对象)包装在DelayedArray对象中,可以对其执行常见的数组操作,而无需将该对象加载到内存中。为了减少内存使用和优化性能,对对象的操作要么延迟,要么使用块处理机制执行。注意,这也适用于内存中类似数组的对象,如DataFrame对象(通常带有Rle列)、Matrix对象以及普通数组和数据帧。
作者:Hervé Pagès
维护人员:Hervé Pagès
引文(从R内,输入引用(“DelayedArray”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("DelayedArray")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“DelayedArray”)
超文本标记语言 | 实现DelayedArray后端 | |
R脚本 | 在R中处理大型数组 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,DataRepresentation,GenomeAnnotation,基础设施,软件 |
版本 | 0.10.0 |
在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(2.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 3.4),方法,统计s4,matrixStats,BiocGenerics(> = 0.27.1),S4Vectors(> = 0.21.7),IRanges(> = 2.17.3),BiocParallel |
进口 | 统计数据,矩阵 |
链接 | S4Vectors |
建议 | 矩阵,HDF5Array,genefilter,SummarizedExperiment,气道,pryr,DelayedMatrixStats,knitr,BiocStyle,RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | DelayedDataFrame,DelayedMatrixStats,GDSArray,HDF5Array,restfulSE,rhdf5client,singleCellTK,SummarizedExperiment,VCFArray |
进口我 | 后面;,beachmat,BiocSingular,bsseq,篮球选手,celaref,ChIPpeakAnno,clusterExperiment,DEScan2,DSS,埃尔默,GenoGAM,hipathia,LoomExperiment,mbkmeans,minfi,netSmooth,RTCGAToolbox,嘘,scmeth,食物 |
建议我 | gwascat,iSEE,S4Vectors |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | DelayedArray_0.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | DelayedArray_0.10.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | DelayedArray_0.10.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DelayedArray |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DelayedArray |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/DelayedArray/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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