DelayedArray

DOI:10.18129 / B9.bioc.DelayedArray

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见DelayedArray

用于透明地处理磁盘上和内存中类似阵列的数据集的统一框架

Bioconductor版本:3.9

将类似数组的对象(通常是磁盘上的对象)包装在DelayedArray对象中,可以对其执行常见的数组操作,而无需将该对象加载到内存中。为了减少内存使用和优化性能,对对象的操作要么延迟,要么使用块处理机制执行。注意,这也适用于内存中类似数组的对象,如DataFrame对象(通常带有Rle列)、Matrix对象以及普通数组和数据帧。

作者:Hervé Pagès ,由Peter Hickey < Peter。>和Aaron Lun 的键盘

维护人员:Hervé Pagès

引文(从R内,输入引用(“DelayedArray”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("DelayedArray")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“DelayedArray”)

超文本标记语言 实现DelayedArray后端
PDF R脚本 在R中处理大型数组
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释DataRepresentationGenomeAnnotation基础设施软件
版本 0.10.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(2.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 3.4),方法,统计s4,matrixStatsBiocGenerics(> = 0.27.1),S4Vectors(> = 0.21.7),IRanges(> = 2.17.3),BiocParallel
进口 统计数据,矩阵
链接 S4Vectors
建议 矩阵HDF5ArraygenefilterSummarizedExperiment气道pryrDelayedMatrixStatsknitrBiocStyleRUnit
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 DelayedDataFrameDelayedMatrixStatsGDSArrayHDF5ArrayrestfulSErhdf5clientsingleCellTKSummarizedExperimentVCFArray
进口我 后面;beachmatBiocSingularbsseq篮球选手celarefChIPpeakAnnoclusterExperimentDEScan2DSS埃尔默GenoGAMhipathiaLoomExperimentmbkmeansminfinetSmoothRTCGAToolboxscmeth食物
建议我 gwascatiSEES4Vectors
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 DelayedArray_0.10.0.tar.gz
Windows二进制 DelayedArray_0.10.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) DelayedArray_0.10.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DelayedArray
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DelayedArray
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/DelayedArray/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: