有限元法

DOI:10.18129 / B9.bioc.FEM

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见有限元法．

功能表观遗传模块的鉴定

Bioconductor版本:3.9

FEM包执行DNA甲基化和基因表达数据的系统级综合分析。它寻找功能相关基因的模块，显示差异启动子DNA甲基化和差异表达，其中启动子DNA甲基化和基因表达之间的反向关联被假设。详情请见Jiao et al Bioinformatics 2014。

作者:Andrew E. Teschendorff，杨震

维护者:Zhen Yang

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("FEM")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“有限元”)

PDF	R脚本	FEM包执行DNA甲基化和基因表达的系统级综合分析。它寻找功能相关基因的模块，显示差异启动子DNA甲基化和差异表达，其中启动子DNA甲基化和基因表达之间的反向关联被假设。详情请见Jiao et al Bioinformatics 2014。
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression，DifferentialMethylation，NetworkEnrichment，软件，SystemsBiology
版本	3.12.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	AnnotationDbi，矩阵，marray，corrplot，igraph，嫁祸于，limma，org.Hs.eg.db，图，BiocGenerics
进口	图
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	冠军
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	FEM_3.12.0.tar.gz
Windows二进制	FEM_3.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	FEM_3.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FEM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/FEM
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/FEM/
软件包下载报告	下载数据