此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GenomicTuples.
Bioconductor版本:3.9
基因组元组定义了存储基因组元组的通用容器。它旨在为基因组坐标元组提供功能,类似于基因组范围生物导体包中可用的基因组范围功能。
作者:Peter Hickey < Peter。希在gmail.com >,with contributions from Marcin Cieslik and Hervé Pagès.
维护者:Peter Hickey < Peter。希在gmail.com >
引用(从R中,输入引用(“GenomicTuples”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" genome ictuples ")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“GenomicTuples”)
超文本标记语言 | R脚本 | GenomicTuplesIntroduction |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataRepresentation,基础设施,测序,软件 |
版本 | 1.18.1 |
Bioconductor自 | bio 3.0 (R-3.1)(5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.3.0),GenomicRanges(> = 1.31.8),GenomeInfoDb(> = 1.15.2),S4Vectors(> = 0.17.25) |
进口 | 方法,BiocGenerics(> = 0.21.2),Rcpp(> = 0.11.2),IRanges(> = 2.13.13),data.table, stats4 |
链接 | Rcpp |
建议 | testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | www.github.com/PeteHaitch/GenomicTuples |
BugReports | https://github.com/PeteHaitch/GenomicTuples/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | GenomicTuples_1.18.1.tar.gz |
Windows二进制 | GenomicTuples_1.18.1.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | GenomicTuples_1.18.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenomicTuples |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GenomicTuples |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/GenomicTuples/ |
包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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