GenomicTuples

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenomicTuples

此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GenomicTuples

基因组元组的表示与操作

Bioconductor版本:3.9

基因组元组定义了存储基因组元组的通用容器。它旨在为基因组坐标元组提供功能,类似于基因组范围生物导体包中可用的基因组范围功能。

作者:Peter Hickey < Peter。希在gmail.com >,with contributions from Marcin Cieslik and Hervé Pagès.

维护者:Peter Hickey < Peter。希在gmail.com >

引用(从R中,输入引用(“GenomicTuples”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" genome ictuples ")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“GenomicTuples”)

超文本标记语言 R脚本 GenomicTuplesIntroduction
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataRepresentation基础设施测序软件
版本 1.18.1
Bioconductor自 bio 3.0 (R-3.1)(5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.3.0),GenomicRanges(> = 1.31.8),GenomeInfoDb(> = 1.15.2),S4Vectors(> = 0.17.25)
进口 方法,BiocGenerics(> = 0.21.2),Rcpp(> = 0.11.2),IRanges(> = 2.13.13),data.table, stats4
链接 Rcpp
建议 testthatknitrBiocStylermarkdown
SystemRequirements
增强了
URL www.github.com/PeteHaitch/GenomicTuples
BugReports https://github.com/PeteHaitch/GenomicTuples/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 GenomicTuples_1.18.1.tar.gz
Windows二进制 GenomicTuples_1.18.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) GenomicTuples_1.18.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenomicTuples
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GenomicTuples
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/GenomicTuples/
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