Greylistchip

doi:10.18129/b9.bioc.greylistchip

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Greylistchip

灰色列表 - 基于芯片输入的面具人工制品区域

生物导体版本:3.9

识别输入中具有高信号的芯片实验区域,这会导致峰值呼叫期间杂散的峰值。删除在峰值通话之前与这些区域保持一致的读取,以进行清洁芯片分析。

作者:Gord Brown > gdbzork>

维护者:Gordon Brown

引用(从r内,输入引用(“ Greylistchip”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ greylistchip”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Greylistchip”)

PDF R脚本 从输入库生成灰色列表
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 结盟,,,,chipseq,,,,覆盖范围,,,,差异词,,,,基因数,,,,预处理,,,,测序,,,,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(4。5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.5),方法,基因组机
进口 基因组签名,,,,BSGENOME,,,,rsamtools,,,,rtracklayer,,,,大量的, 平行,GenomeInfodB,,,,总结性特征,统计,utils
链接
建议 生物使用,,,,生物基因,,,,运行
系统要求
增强 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 GreylistChip_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 GreylistChip_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) GreylistChip_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/greylistchip
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/greylistchip
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/greylistchip/
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