检查

DOI:10.18129 / B9.bioc.INSPEcT

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见检查．

4sU-seq和RNA-seq时间过程数据分析

Bioconductor版本:3.9

INSPEcT(从转录组数据中推断合成、处理和降解率)在时间过程实验或不同条件下的RNA-seq数据，有或没有新生RNA数据的支持。

作者:Stefano de Pretis

维护者:Stefano de Pretis

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("INSPEcT")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“检查”)

PDF	R脚本	检查
PDF	R脚本	RNAdynamics
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneRegulation，RNASeq，测序，软件，SystemsBiology，TimeCourse
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(4年)
许可证	GPL-2
取决于	R(>= 3.2)，方法，Biobase，BiocParallel
进口	pROC，deSolve，rootSolve编译器,preprocessCore，GenomicFeatures，GenomicRanges，IRanges，BiocGenerics，GenomicAlignments，Rsamtools，S4Vectors，DESeq2，plgem，SummarizedExperiment，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene，闪亮的
链接
建议	BiocStyle，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	INSPEcT_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	INSPEcT_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	INSPEcT_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/INSPEcT
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/INSPEcT
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/INSPEcT/
软件包下载报告	下载数据