Interminer
doi：10.18129/b9.bioc.interminer
该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅Interminer。
R接口与跨驱动数据库
生物导体版本：3.9
基于Intermine平台的数据库，例如Flymine，Modmine（Modencode），Ratmine，Ratmine，Yeastmine，Humanmine和Targetmine是各种生物体的基因组，表达和蛋白质数据的集成数据库。集成数据使得可以运行跨越生物知识领域的复杂数据挖掘查询。该R软件包通过网络服务提供与这些数据库的接口。它最大程度自由地源自R在R中的数据框对象和数据库中的表对象，同时通过XML或JSON隐藏数据交换的详细信息。
作者：Bing Wang，Julie Sullivan，Rachel Lyne，Konstantinos Kyritsis
维护者：跨团队
引用（从r内，输入引用（“ Interminer”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ Interminer”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Interminer”）
| html | R脚本 | 富集分析和可视化 |
| html | R脚本 | Flymine基因组可视化 |
| html | R脚本 | 跨工具 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 替代方案，，，，比较基因组学，，，，差异性，，，，功能基因组学，，，，功能性预测，，，，去，，，，基因表达，，，，结肠管制，，，，基因烯，，，，基因数，，，，Genomewideassociation，，，，kegg，，，，微阵列，，，，多重组合，，，，途径，，，，蛋白质组学，，，，Reactome，，，，SNP，，，，软件，，，，系统生物学，，，，可视化 |
| 版本 | 1.6.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.6（R-3.4）（2年） |
| 执照 | LGPL |
| 要看 | R（> = 3.4.1） |
| 进口 | 生物弦，，，，rcurl，，，，XML，，，，XML2，，，，rjsonio，，，，SQLDF，，，，Igraph，，，，httr，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，基因组机，，，，总结性特征， 方法 |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，GVIZ，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，Geneanswers，，，，go.db，，，，org.hs.eg.db |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/intermine/interminer/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Interminer_1.6.1.tar.gz |
| Windows二进制 | Interminer_1.6.1.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | Interminer_1.6.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/interminer |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/跨工具 |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/interminer/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
