该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅互动集。
生物导体版本:3.9
提供Ginteractions,Intercontionset和Contactionset和Contactmatrix对象以及相关的方法,用于存储和操纵HI-C和CHIA-PET实验的基因组相互作用数据。
作者:Aaron Lun [AUT,CRE],Malcolm Perry [AUT],Elizabeth Ingmmons [aut]
维护者:aaron lun
引用(从r内,输入引用(“ Interactionset”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ InteractionSet”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ Interactionset”)
html | R脚本 | 与基因组相互作用数据的相互作用集相互作用 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | datarepresentation,,,,嗝,,,,基础设施,,,,软件 |
版本 | 1.12.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(3。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | 基因组机,,,,总结性特征 |
进口 | iranges,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB,,,,生物基因, 方法,矩阵,,,,RCPP |
链接 | RCPP |
建议 | 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用 |
系统要求 | C ++ 11 |
增强 | |
URL | |
取决于我 | Diffhic,,,,基因组间,,,,Macpet,,,,塞文 |
进口我 | Cagefightr,,,,Hiccompare,,,,TrackViewer |
建议我 | CageWorkFlow |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Interactionset_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | Interactionset_1.12.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | Interactionset_1.12.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/interactionset |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/互动集 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/interactionset/ |
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