该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅接口。
生物导体版本:3.9
RNA-Seq数据中差分外显子或剪接结构使用情况检测和可视化的实用程序。
作者:Stephen Hartley [AUT,CRE](博士学位),Simon Anders [CPH],Alejandro Reyes [CPH]
维护人员:Stephen Hartley
引用(从r内,输入引用(“ innctionseq”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ innctionseq”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ innctionseq”)
接口式小插图 | ||
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 差异性,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(3。5年) |
执照 | 文件许可证 |
要看 | R(> = 3.2.2),方法,总结性特征(> = 0.2.0),RCPP(> = 0.11.0),rcpparmadillo(> = 0.3.4.4) |
进口 | deseq2(> = 1.10.0),Statmod,,,,HMISC,,,,plotrix,,,,Stringr,,,,生物酶(> = 2.30.0),Locfit,,,,生物基因(> = 0.7.5),生物比较,,,,GeneFilter,,,,Geneplotter,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,基因组机 |
链接 | RCPP,,,,rcpparmadillo |
建议 | 大量的,,,,尼特,,,,JCTSEQDATA,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | 开罗,,,,普里尔 |
URL | http://hartleys.github.io/junctionseq/index.html |
BugReports | https://github.com/hartleys/junctionseq/issues |
取决于我 | |
进口我 | 途径图 |
建议我 | JCTSEQDATA |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | inctionseq_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | inctionseq_1.14.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | inctionseq_1.14.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/junctionseq |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/innctionseq |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/junctionseq/ |
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