Logolas

DOI:10.18129 / B9.bioc.Logolas

此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本，请参见Logolas．

EDLogo图具有字符串标识和位置-权重矩阵的自适应缩放

Bioconductor版本:3.9

生成标识图，突出显示字符的丰富和减少，允许绘制字符串符号，自适应地执行位置-权重的缩放，以及一些有趣的程式化。

作者:Kushal Dey [aut, cre]，谢东岳[aut]， Peter Carbonetto [ctb]， Matthew Stephens [aut]

维护者:Kushal Dey

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Logolas")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“Logolas”)

超文本标记语言	R脚本	引导Logolas教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，贝叶斯，SequenceMatching，软件，可视化
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (R-3.4)(2.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.4)
进口	网格,SQUAREM，LaplacesDemon，统计，图形，工具，ggplot2，gridBase，Biostrings
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle，Biobase，devtools，xtable，gridExtra，RColorBrewer，seqLogo，ggseqlogo
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/kkdey/Logolas
BugReports	http://github.com/kkdey/Logolas/issues
取决于我
进口我
建议我	universalmotif
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	Logolas_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	Logolas_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	Logolas_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Logolas
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Logolas
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Logolas/
包下载报告	下载数据