Mageckflute
doi：10.18129/b9.bioc.mageckflute
该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅Mageckflute。
合并CRISPR功能遗传筛选的综合分析管道
生物导体版本：3.9
Mageckflute旨在利用Mageck或Mageck-vispr提供的基因摘要数据进行横向分析。在管道中执行质量控制，标准化和CRISPR屏幕数据识别。在管道中识别的命中是根据实验设计对鉴定出的，随后通过功能富集分析来解释。
作者：王张，费津顿·吴，本宾·王
维护者：张张
引用（从r内，输入引用（“ Mageckflute”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ mageckeckflute”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ MageckFlute”）
| html | R脚本 | mageckflute.rmd |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 批处理效应，，，，CRISPR，，，，功能基因组学，，，，基因烯，，，，免疫学，，，，正常化，，，，途径，，，，QualityControl，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.4.3 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.7（R-3.5）（1。5年） |
| 执照 | GPL（> = 3） |
| 要看 | r（> = 3.5），GGPLOT2，统计，grdevices，utils，栅格 |
| 进口 | ggextra，，，，GGSCI，，，，Ggrepel，，，，clusterProfiler，，，，PNG，，，，Data.Table，，，，pheatmap，，，，SVA，，，，剂量，，，，Biomart， 网格，PathView |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，org.mm.eg.db |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | mageckflute_1.4.3.3.tar.gz |
| Windows二进制 | mageckflute_1.4.3.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | mageckflute_1.4.3.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mageckflute |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/mageckflute |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/mageckflute/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
