工商管理硕士

DOI:10.18129 / B9.bioc.MBASED

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见工商管理硕士

包包含功能ASE分析使用元分析基于等位基因特异性表达检测

Bioconductor版本:3.9

该软件包实现了mbase算法,用于从RNA计数数据中检测等位基因特异性基因表达,其中单个位点(SNVs)上的等位基因计数被集成到ASE的基因特异性测量中,并利用模拟适当地评估所观察到的ASE的统计显著性。

作者:奥列格·梅巴,休斯顿·吉尔伯特

维护者:Oleg Mayba < Mayba。奥列格在gene.com>

引文(从R内,输入引用(mba)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MBASED")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes (mba)

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文本 新闻

细节

biocViews GeneExpression测序软件转录
版本 1.18.0
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 RUnitBiocGenericsBiocParallelGenomicRangesSummarizedExperiment
进口
链接
建议 BiocStyle
SystemRequirements
增强了
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全靠我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 MBASED_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 MBASED_1.18.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) MBASED_1.18.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MBASED
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ mbase
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/MBASED/
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