这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见工商管理硕士.
Bioconductor版本:3.9
该软件包实现了mbase算法,用于从RNA计数数据中检测等位基因特异性基因表达,其中单个位点(SNVs)上的等位基因计数被集成到ASE的基因特异性测量中,并利用模拟适当地评估所观察到的ASE的统计显著性。
作者:奥列格·梅巴,休斯顿·吉尔伯特
维护者:Oleg Mayba < Mayba。奥列格在gene.com>
引文(从R内,输入引用(mba)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MBASED")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes (mba)
R脚本 | 工商管理硕士 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneExpression,测序,软件,转录 |
版本 | 1.18.0 |
在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | RUnit,BiocGenerics,BiocParallel,GenomicRanges,SummarizedExperiment |
进口 | |
链接 | |
建议 | BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | MBASED_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | MBASED_1.18.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | MBASED_1.18.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MBASED |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ mbase |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/MBASED/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: