米拉

DOI:10.18129 / B9.bioc.MIRA

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见米拉．

甲基化调控活性的推断

Bioconductor版本:3.9

MIRA测量感兴趣的调控位点(如转录因子结合位点)周围甲基化水平的“下降”程度，用于整个基因组中该类型位点的实例，然后用于推断调控活性。

作者:Nathan Sheffield [aut]， Christoph Bock [ctb]， John Lawson [aut, cre]

维护者:John Lawson

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("MIRA")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“米拉”)

超文本标记语言	R脚本	MIRA在生物学问题中的应用
超文本标记语言	R脚本	以甲基化为基础的调控活性推断
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，报道，DNAMethylation，表观遗传学，FunctionalGenomics，GeneRegulation，GenomeAnnotation，ImmunoOncology，MethylSeq，测序，软件，SystemsBiology
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.5)
进口	BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，data.table，ggplot2，Biobase统计数据,bsseq、方法
链接
建议	knitr平行,testthat，BiocStyle，rmarkdown，AnnotationHub，萝拉
SystemRequirements
增强了
URL	http://databio.org/mira
BugReports	https://github.com/databio/MIRA
全靠我
进口我	可可
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	MIRA_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	MIRA_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MIRA_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MIRA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MIRA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MIRA/
软件包下载报告	下载数据