此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本,请参见MLSeq.
Bioconductor版本:3.9
该软件包将几种机器学习方法应用于RNA-Seq数据,包括支持向量机(SVM)、bagSVM、随机森林(Random Forest)和CART。
作者:Gokmen Zararsiz [aut, cre], Dincer Goksuluk [aut], Selcuk Korkmaz [aut], Vahap Eldem [aut], Izzet Parug Duru [ctb], Ahmet Ozturk [aut], Ahmet Ergun Karaagaoglu [aut, ths]
维护人员:Gokmen Zararsiz
引用(从R中,输入引用(“MLSeq”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“MLSeq”)
R脚本 | “MLSeq”包的初学者指南 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 分类,聚类,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件 |
版本 | 2.2.1 |
Bioconductor自 | BioC 2.14 (R-3.1)(5.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | 脱字符号,ggplot2 |
进口 | 方法,DESeq2,刨边机,limma,Biobase,SummarizedExperiment,plyr,foreach跑龙套,sSeq,xtable |
链接 | |
建议 | knitr,testthat,BiocStyle,维恩图,pamr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | 空对空导弹 |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | MLSeq_2.2.1.tar.gz |
Windows二进制 | MLSeq_2.2.1.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | MLSeq_2.2.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MLSeq |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MLSeq |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/MLSeq/ |
包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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