MLSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.MLSeq

此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本,请参见MLSeq

rna序列数据的机器学习接口

Bioconductor版本:3.9

该软件包将几种机器学习方法应用于RNA-Seq数据,包括支持向量机(SVM)、bagSVM、随机森林(Random Forest)和CART。

作者:Gokmen Zararsiz [aut, cre], Dincer Goksuluk [aut], Selcuk Korkmaz [aut], Vahap Eldem [aut], Izzet Parug Duru [ctb], Ahmet Ozturk [aut], Ahmet Ergun Karaagaoglu [aut, ths]

维护人员:Gokmen Zararsiz

引用(从R中,输入引用(“MLSeq”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“MLSeq”)

PDF R脚本 “MLSeq”包的初学者指南
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 分类聚类ImmunoOncologyRNASeq测序软件
版本 2.2.1
Bioconductor自 BioC 2.14 (R-3.1)(5.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 脱字符号ggplot2
进口 方法,DESeq2刨边机limmaBiobaseSummarizedExperimentplyrforeach跑龙套,sSeqxtable
链接
建议 knitrtestthatBiocStyle维恩图pamr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我 空对空导弹
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 MLSeq_2.2.1.tar.gz
Windows二进制 MLSeq_2.2.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) MLSeq_2.2.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MLSeq
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MLSeq
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/MLSeq/
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