普通剂

doi:10.18129/b9.bioc.normalyzerde

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅普通剂

评估归一化方法和差异表达分析统计的计算

生物导体版本:3.9

andaryzerde提供了基于LC-MS的表达数据的归一化方法的筛选。它使用现有方法和新颖的时间分段方法来计算一系列归一化矩阵,计算性能度量并生成评估报告。此外,它为基于Limma或ANOVA-基于差异的表达分析提供了简单的实用性。

作者:Jakob Willforss

维护者:jakob willforss

引用(从r内,输入引用(“ narryyzerde”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ normalyzerde”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ narryyzerde”)

PDF R脚本 使用普通齐D的差异表达和反对技术偏见
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 贝叶斯,,,,差异性,,,,代谢组学,,,,多重组合,,,,正常化,,,,蛋白质组学,,,,软件,,,,可视化
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.8(R-3.5)(1年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.5)
进口 VSN,,,,预处理,,,,林玛,,,,大量的,,,,,,,,,,,,GGPLOT2, 方法,生物酶,,,,rcmdrmisc,,,,栅格,utils,统计,总结性特征,,,,矩阵,,,,GGFORCE
链接
建议 尼特,,,,测试,,,,rmarkDown,,,,roxygen2,,,,Hexbin,,,,生物使用
系统要求
增强
URL https://github.com/computational Proteomics/normalyzerde
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 normalyzerde_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 normalyzerde_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) normalyzerde_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/normalyzerde
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/normalyzerde
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/normalyzerde/
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