这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见奥纳西斯.
Bioconductor版本:3.9
一个包,允许使用本体术语(主要来自OBO本体)注释文本,并基于不同注释样本之间的本体结构计算语义相似性度量。
作者:Eugenia Galeota
维护者:Eugenia Galeota < Eugenia。Galeota在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“奥纳西斯”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Onassis")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“奥纳西斯”)
超文本标记语言 | R脚本 | Onassis:本体注释和语义相似性软件 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,聚类,DataImport,GeneTarget,网络,软件 |
版本 | 1.6.1 |
在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(2年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.4),rJava,OnassisJavaLibs |
进口 | GEOmetadb,RSQLite,data.table,方法,工具,utils,AnnotationDbi,RCurl统计数据,DT,data.table,knitr |
链接 | |
建议 | BiocStyle,rmarkdown,htmltools,org.Hs.eg.db,gplots,GenomicRanges,kableExtra |
SystemRequirements | Java (>= 1.8) |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | Onassis_1.6.1.tar.gz |
Windows二进制 | Onassis_1.6.1.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | Onassis_1.6.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Onassis |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Onassis |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/Onassis/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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