Pbase

DOI:10.18129 / B9.bioc.Pbase

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见Pbase．

操作和探索蛋白质和蛋白质组学数据

Bioconductor版本:3.9

在蛋白质组学实验中用于研究和理解蛋白质序列数据的一组类和函数。

作者:Laurent Gatto [aut]， Sebastian Gibb [aut, cre]

维护者:Sebastian Gibb ， Laurent Gatto

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("Pbase")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“Pbase”)

超文本标记语言	R脚本	Pbase数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，ImmunoOncology，基础设施，MassSpectrometry，蛋白质组学，软件，可视化
版本	0.24.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(4.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R(>= 2.10)，方法，BiocGenerics，Rcpp，Gviz
进口	切肉刀(> = 1.3.6),Biobase，Biostrings(> = 2.47.5),IRanges(> = 2.13.11),S4Vectors(> = 0.17.24),mzID，mzR(> = 1.99.1),MSnbase(> = 1.15.5),Pviz，biomaRt，GenomicRanges(> = 1.31.7),rtracklayer(> = 1.39.6),ensembldb(> = 1.99.13),BiocParallel，AnnotationFilter
链接
建议	testthat(> = 0.8),ggplot2，BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene，AnnotationHub，knitr，rmarkdown，BiocStyle，EnsDb.Hsapiens.v86(> = 2.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ComputationalProteomicsUnit/Pbase
BugReports	https://github.com/ComputationalProteomicsUnit/Pbase/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	Pbase_0.24.0.tar.gz
Windows二进制	Pbase_0.24.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	Pbase_0.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Pbase
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Pbase
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Pbase/
软件包下载报告	下载数据