RCY3

doi:10.18129/b9.bioc.rcy3

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅RCY3

访问和控制Cytoscape的功能

生物导体版本:3.9

使用Cytoscape通过R。

作者:Alex Pico [AUT,CRE],Tanja Muetze [Aut],Paul Shannon [AUT],Ruth Isserlin [CTB],Shraddha Pai [CTB],Julia Gustavsen [CTB],Georgi Kolishovski [CTB]

维护者:Alex pico

引用(从r内,输入引用(“ RCY3”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rcy3”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ RCY3”)

html R脚本 01. RCY3〜25分钟的概述
html R脚本 02. Cytoscape和Igraph〜5分钟
html R脚本 03. Cytoscape和Graphnel〜5分钟
html R脚本 04.导入数据〜5分钟
html R脚本 05.网络功能和可视化〜15分钟
html R脚本 06.癌症网络和数据〜40分钟
html R脚本 07.标识符映射〜20分钟
html R脚本 08.升​​级现有脚本〜15分钟
html R脚本 09. Cytoscape和Ndex〜20分钟
html R脚本 10.组节点〜15分钟
html R脚本 11.自定义图形和标签〜10分钟
html R脚本 12.过滤网络〜10分钟
html R脚本 13.系统发育〜3分钟
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 GraphandNetwork,,,,网络,,,,软件,,,,第三派对人,,,,可视化
版本 2.4.6
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(4年)
执照 麻省理工学院 +文件许可证
要看
进口 httr, 方法,rjsonio,,,,XML,utils,生物基因,,,,Igraph,统计图形,,,,r.utils
链接
建议 运行,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求 Cytoscape(> = 3.7.1),Cyrest(> = 3.8.0)
增强
URL https://github.com/cytoscape/rcy3
BugReports https://github.com/cytoscape/rcy3/issues
取决于我
进口我 类别Compare,,,,ncigraph
建议我 石墨,,,,rscudo
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 RCY3_2.4.6.tar.gz
Windows二进制 rcy3_2.4.6.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) RCY3_2.4.6.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rcy3
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rcy3
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/rcy3/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户