该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅RCY3。
生物导体版本:3.9
使用Cytoscape通过R。
作者:Alex Pico [AUT,CRE],Tanja Muetze [Aut],Paul Shannon [AUT],Ruth Isserlin [CTB],Shraddha Pai [CTB],Julia Gustavsen [CTB],Georgi Kolishovski [CTB]
维护者:Alex pico
引用(从r内,输入引用(“ RCY3”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rcy3”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ RCY3”)
html | R脚本 | 01. RCY3〜25分钟的概述 |
html | R脚本 | 02. Cytoscape和Igraph〜5分钟 |
html | R脚本 | 03. Cytoscape和Graphnel〜5分钟 |
html | R脚本 | 04.导入数据〜5分钟 |
html | R脚本 | 05.网络功能和可视化〜15分钟 |
html | R脚本 | 06.癌症网络和数据〜40分钟 |
html | R脚本 | 07.标识符映射〜20分钟 |
html | R脚本 | 08.升级现有脚本〜15分钟 |
html | R脚本 | 09. Cytoscape和Ndex〜20分钟 |
html | R脚本 | 10.组节点〜15分钟 |
html | R脚本 | 11.自定义图形和标签〜10分钟 |
html | R脚本 | 12.过滤网络〜10分钟 |
html | R脚本 | 13.系统发育〜3分钟 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | GraphandNetwork,,,,网络,,,,软件,,,,第三派对人,,,,可视化 |
版本 | 2.4.6 |
在生物导体中 | Bioc 3.2(R-3.2)(4年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件许可证 |
要看 | |
进口 | httr, 方法,rjsonio,,,,XML,utils,生物基因,,,,Igraph,统计图形,,,,r.utils |
链接 | |
建议 | 运行,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | Cytoscape(> = 3.7.1),Cyrest(> = 3.8.0) |
增强 | |
URL | https://github.com/cytoscape/rcy3 |
BugReports | https://github.com/cytoscape/rcy3/issues |
取决于我 | |
进口我 | 类别Compare,,,,ncigraph |
建议我 | 石墨,,,,rscudo |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | RCY3_2.4.6.tar.gz |
Windows二进制 | rcy3_2.4.6.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | RCY3_2.4.6.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rcy3 |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rcy3 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/rcy3/ |
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