该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Ruvseq。
生物导体版本:3.9
该软件包实现了Risso等人的删除不需要的变化(RUV)方法。(2014)用于在样品之间进行RNA-Seq读数的归一化。
作者:Davide Risso [AUT,CRE,CPH],Sandrine Dudoit [aut],Lorena Pantano [CTB],Kamil Slowikowski [CTB]
维护者:davide risso
引用(从r内,输入引用(“ ruvseq”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ruvseq”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ ruvseq”)
R脚本 | RUVSEQ:从RNA-Seq数据中删除不需要的变化 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 差异性,,,,免疫学,,,,预处理,,,,rnaseq,,,,软件 |
版本 | 1.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | 生物酶,,,,EDASEQ(> = 1.99.1),EDGER |
进口 | 方法,大量的 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rcolorbrewer,,,,斑马鱼,,,,deseq2 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/drisso/ruvseq |
BugReports | https://github.com/drisso/ruvseq/issues |
取决于我 | rnaseqgene |
进口我 | 共识,,,,烤饼 |
建议我 | DESCAN2 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ruvseq_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | ruvseq_1.18.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | ruvseq_1.18.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ruvseq |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/ruvseq |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/ruvseq/ |
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