国家环保总局

DOI:10.18129 / B9.bioc.SEPA

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见国家环保总局。

国家环保总局

Bioconductor版本:3.9

给定单细胞RNA-seq数据和细胞的真实实验时间或伪时间细胞排序，SEPA为用户将基因分配到恒定、单调递增、先递增后递减等不同的基因表达模式提供了方便的功能。然后SEPA进行GO富集分析，分析具有相同或相似模式的基因的功能作用。

作者:纪志成，纪鸿凯

维护者:zhiicheng Ji

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("SEPA")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes (SEPA)

PDF	R脚本	SEPA:单细胞基因表达模式分析
PDF		参考手册

细节

biocViews	去，GUI，GeneExpression，软件，可视化
版本	1.13.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(4年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (>= 2.10.0)
进口	ggplot2，闪亮的，topGO，分段，reshape2，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	SEPA_1.13.0.tar.gz
Windows二进制	SEPA_1.13.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	SEPA_1.13.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SEPA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SEPA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SEPA/
软件包下载报告	下载数据