STROMA4

DOI:10.18129 / B9.bioc.STROMA4

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅STROMA4。

TNBC患者分配属性

Bioconductor版本:3.9

这个包估计四TNBC患者基质性质确定每个病人的基因表达数据集。这些基质财产分配可以结合亚型患者。这四种基质性质被确定在三阴乳腺癌(TNBC)患者和代表的存在不同的细胞间质:T细胞(T), B细胞(B),间质浸润上皮细胞(E)和粘连形成(D)。另外这个包也可以用来估计生成属性莱曼亚型,另一种TNBC子类型化方案(PMID: 21633166)。

作者:Sadiq萨利赫(aut (cre),迈克尔·哈雷特(aut)

维护人员:Sadiq萨利赫< Sadiq。在mail.mcgill.ca mehdiismailsaleh >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“STROMA4”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“STROMA4”)

PDF	R脚本	使用STROMA4包
PDF		参考手册

细节

biocViews	BiomedicalInformatics,分类,GeneExpression,ImmunoOncology,微阵列,RNASeq,软件
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.4),Biobase,BiocParallel,集群,matrixStats、统计数据、图形,跑龙套
进口
链接
建议	breastCancerMAINZ
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	STROMA4_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	STROMA4_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	STROMA4_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/STROMA4
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ STROMA4
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/STROMA4/
包下载报告	下载数据