Singlecellexperiment

doi:10.18129/b9.bioc.singlecellexperiment

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Singlecellexperiment

单元数据的S4类

生物导体版本:3.9

定义用于从单细胞实验存储数据的S4类。这包括用于存储和检索每个细胞的峰值信息的专门方法,降低降低坐标和尺寸因子以及基因和库的通常元数据。

作者:Aaron Lun [AUT,CPH],Davide Risso [AUT,CRE,CPH],Keegan Korthauer [CTB]

维护者:davide risso

引用(从r内,输入引用(“ Singlecellexperiment”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ singlecellexperiment”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Singlecellexperiment”)

html R脚本 1. Singlecellexperiment课程的介绍
html R脚本 2.围绕单圈体验班的发展
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,datarepresentation,,,,免疫学,,,,基础设施,,,,Singlecell,,,,软件
版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 3.6(R-3.4)(2年)
执照 GPL-3
要看 总结性特征
进口 S4VECTORS, 方法,生物基因,utils,统计
链接
建议 测试,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,scrnaseq,,,,马格里特,,,,RTSNE,,,,矩阵
系统要求
增强
URL
取决于我 AllenPVC,,,,基本,,,,Batchelor,,,,蜂窝架,,,,蜂窝轨道,,,,切塔,,,,簇发酵,,,,Cydar,,,,液滴,,,,HCADATA,,,,我明白,,,,loomexpermiment,,,,桅杆,,,,评分,,,,scpipe,,,,斯克兰,,,,Singlecelltk,,,,飞溅,,,,switchde,,,,tenxbraindata,,,,tenxpbmcdata,,,,树木化的特殊性,,,,Zinbwave
进口我 Baynorm,,,,BEARSCC,,,,催化剂,,,,ccfindr,,,,细胞混蛋,,,,COGAPS,,,,校正,,,,谱系,,,,mbkmeans,,,,NetSmooth,,,,Phemd,,,,SC3,,,,缩放,,,,SCDD,,,,SCDS,,,,scfind,,,,scmap,,,,Scmerge,,,,scnorm,,,,颈背,,,,sctensor,,,,激流回旋,,,,弹弓
建议我 desingle,,,,命运,,,,DuoClustering2018,,,,FCBF,,,,M3Drop,,,,苯酚,,,,scfeaturefilter,,,,滚动,,,,Simplesinglecell,,,,Tabulamurisdata
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 singlecellexperiment_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 singlecellexperiment_1.6.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) singlecellexperiment_1.6.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/singlecellexperiment
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/singlecellexperiment
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/singlecellexperiment/
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