该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Singlecellexperiment。
生物导体版本:3.9
定义用于从单细胞实验存储数据的S4类。这包括用于存储和检索每个细胞的峰值信息的专门方法,降低降低坐标和尺寸因子以及基因和库的通常元数据。
作者:Aaron Lun [AUT,CPH],Davide Risso [AUT,CRE,CPH],Keegan Korthauer [CTB]
维护者:davide risso
引用(从r内,输入引用(“ Singlecellexperiment”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ singlecellexperiment”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Singlecellexperiment”)
html | R脚本 | 1. Singlecellexperiment课程的介绍 |
html | R脚本 | 2.围绕单圈体验班的发展 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DataImport,,,,datarepresentation,,,,免疫学,,,,基础设施,,,,Singlecell,,,,软件 |
版本 | 1.6.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.6(R-3.4)(2年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | 总结性特征 |
进口 | S4VECTORS, 方法,生物基因,utils,统计 |
链接 | |
建议 | 测试,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,scrnaseq,,,,马格里特,,,,RTSNE,,,,矩阵 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | AllenPVC,,,,基本,,,,Batchelor,,,,蜂窝架,,,,蜂窝轨道,,,,切塔,,,,簇发酵,,,,Cydar,,,,液滴,,,,HCADATA,,,,我明白,,,,loomexpermiment,,,,桅杆,,,,评分,,,,scpipe,,,,斯克兰,,,,Singlecelltk,,,,飞溅,,,,switchde,,,,tenxbraindata,,,,tenxpbmcdata,,,,树木化的特殊性,,,,Zinbwave |
进口我 | Baynorm,,,,BEARSCC,,,,催化剂,,,,ccfindr,,,,细胞混蛋,,,,COGAPS,,,,校正,,,,谱系,,,,mbkmeans,,,,NetSmooth,,,,Phemd,,,,SC3,,,,缩放,,,,SCDD,,,,SCDS,,,,scfind,,,,scmap,,,,Scmerge,,,,scnorm,,,,颈背,,,,sctensor,,,,激流回旋,,,,弹弓 |
建议我 | desingle,,,,命运,,,,DuoClustering2018,,,,FCBF,,,,M3Drop,,,,苯酚,,,,scfeaturefilter,,,,滚动,,,,Simplesinglecell,,,,Tabulamurisdata |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | singlecellexperiment_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | singlecellexperiment_1.6.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | singlecellexperiment_1.6.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/singlecellexperiment |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/singlecellexperiment |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/singlecellexperiment/ |
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