TMixClust

DOI:10.18129 / B9.bioc.TMixClust

此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本，请参见TMixClust．

基于高斯混合效应模型和平滑样条的基因表达时间序列聚类

Bioconductor版本:3.9

基于高斯变量和非参数三次样条估计混合效应模型的时间序列基因表达数据聚类方法的实现。该方法可以稳健地解释典型基因表达时间序列数据集中存在的高水平噪声。

作者:Monica Golumbeanu < Golumbeanu。莫妮卡:gmail.com >

维护者:Monica Golumbeanu < Golumbeanu。莫妮卡:gmail.com >

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("TMixClust")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“TMixClust”)

PDF	R脚本	用TMixClust聚类时间序列基因表达数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类，GeneExpression，软件，StatisticalMethod，TimeCourse
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (R-3.4)(2年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.4)
进口	gss，mvtnorm统计数据,动物园，集群跑龙套,BiocParallel，flexclustgrDevices图形,Biobase，SPEM
链接
建议	rmarkdown，knitr，BiocStyle，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	TMixClust_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	TMixClust_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	TMixClust_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TMixClust
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TMixClust
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TMixClust/
包下载报告	下载数据