affy
DOI:
10.18129 / B9.bioc.affy
这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅affy。
方法Affymetrix寡核苷酸阵列
Bioconductor版本:3.9
包包含用于探索性寡核苷酸阵列分析功能。依赖tkWidgets只关注一些方便的功能。“affy”是没有它功能齐全。
作者:拉斐尔·a·伊<拉法在jhu.edu >, Laurent Gautier < lgautier gmail.com >,本杰明·米洛Bolstad < bmb bmbolstad.com >,和< cmiller Crispin米勒picr.man.ac。英国的贡献> Magnus搁浅地<马格努斯。搁浅地在astrazeneca.com >,莱斯利·m·应对< mts.jhu.edu >,罗伯特先生,杰夫绅士,康拉德哈林舞< agilixcorp.com >们聊天,沃尔夫冈•休伯詹姆斯•麦克唐纳< jmacdon u.washington.edu >本杰明·i·鲁宾斯坦克里斯托弗工人cbs.dtu <工人。dk >,约翰
维护人员:拉斐尔·a·伊<拉法在jhu.edu >
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“affy”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“affy”)
细节
biocViews |
微阵列,OneChannel,预处理,软件 |
版本 |
1.62.0 |
Bioconductor自 |
BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 14.5年) |
许可证 |
LGPL (> = 2.0) |
取决于 |
R (> = 2.8.0),BiocGenerics(> = 0.1.12),Biobase(> = 2.5.5) |
进口 |
affyio(> = 1.13.3),BiocManager、图形grDevices、方法preprocessCore,统计,跑龙套,zlibbioc |
链接 |
preprocessCore |
建议 |
tkWidgets(> = 1.19.0),affydata,widgetTools |
SystemRequirements |
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增强了 |
|
URL |
|
取决于我 |
affyContam,affydata,AffyExpress,affyPara,affypdnn,affyPLM,affyQCReport,AffyRNADegradation,AgiMicroRna,ALLMLL,altcdfenvs,AmpAffyExample,arrayMvout,ArrayTools,bgx,bronchialIL13,ccTutorial,ChimpHumanBrainData,慢性淋巴细胞白血病,Cormotif,curatedBladderData,curatedOvarianData,DrugVsDisease,dualKS,ecoliLeucine,ExiMiR,农场,frmaTools,gcrma,Hiiragi2013,LMGene,logitT,maPredictDSC,MAQCsubset,MAQCsubsetAFX,maskBAD,中长期规划,mvoutData,panp,plw,prebs,PREDAsampledata,pumadata,qpcrNorm,RefPlus,rHVDM,Risa,战,SCAN.UPC,simpleaffy,SpikeIn,SpikeInSubset,sscore,斯塔尔,webbioc,XhybCasneuf |
进口我 |
affycoretools,affyILM,affylmGUI,affyQCReport,arrayQualityMetrics,ArrayTools,咖啡馆,ChIPXpress,coexnet,Cormotif,crossmeta,DeSousa2013,Doscheda,天哪,农场,ffpe,frma,gcrma,GEOsubmission,Harshlight,HTqPCR,iCheck,光民,LVSmiRNA,makecdfenv,mimager,MSnbase,PECA,钳子,plw,彪马,pvac,rat2302frmavecs,rCGH,Rnits,simpleaffy,STATegRa,tilingArray,TurboNorm,vsn,waveTiling |
建议我 |
AnnotationForge,ArrayExpress,数组,beadarray,beadarraySNP,BiocCaseStudies,BiocGenerics,Biostrings,BufferedMatrixMethods,categoryCompare,ecolitk,雌激素,ExpressionView,factDesign,ffpeExampleData,gCMAPWeb,GeneRegionScan,limma,made4,paxtoolsr,钢琴,PREDA,qcmetrics,runibic,siggenes,TCGAbiolinks |
我的链接 |
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构建报告 |
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包档案
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