affyQCReport

DOI:10.18129 / B9.bioc.affyQCReport

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅affyQCReport

为affyBatch对象QC报告生成

Bioconductor版本:3.9

这个包为一个AffyBatch对象创建一份质检报告。这份报告的目的是允许用户快速评估的质量一组在一个AffyBatch对象数组。

作者:克雷格Parman <克雷格。在bifx.org parman >,Conrad Halling , Robert Gentleman

维护人员:克雷格Parman <克雷格。在bifx.org parman >

从内部引用(R,回车引用(“affyQCReport”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“affyQCReport”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“affyQCReport”)

PDF R脚本 affyQCReport:生成Affymetrix QC报告的方法
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列,OneChannel,质量控制,软件
版本 1.62.0
Bioconductor自 BioC 1.7 (r - 2.2)(14年)
许可证 LGPL (> = 2)
取决于 Biobase(> = 1.13.16),affy,晶格
进口 affy,affyPLM,Biobase,genefilter、图形、grDevices晶格,RColorBrewer,simpleaffy,统计,跑龙套,xtable
链接
建议 tkWidgets(> = 1.5.23),affydata(> = 1.4.1)
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我 BiocCaseStudies
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包 affyQCReport_1.62.0.tar.gz
Windows二进制 affyQCReport_1.62.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) affyQCReport_1.62.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affyQCReport
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ affyQCReport
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/affyQCReport/
包下载报告 下载数据

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