该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Artms。
生物导体版本:3.9
ARTMS提供了一组用于分析蛋白质组学标签数据集的工具。它以最大搜索结果输出(证据.txt文件)为输入,并执行质量控制,使用MSSTATS,下游分析和集成。ARTMS还提供了一组功能来重新格式化并与其他分析工具兼容,包括Saintq,SaintExpress,Phosfate和Photon。检查[http://artms.org](http://artms.org)以获取详细信息。
作者:David Jimenez-Morales,Alexandre Rosa Campos,John von Dollen。
维护者:David Jimenez-Morales
引用(从r内,输入引用(“ Artms”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ artms”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Artms”)
html | R脚本 | 学习使用Artms |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 注解,,,,生物医学信息学,,,,聚类,,,,差异性,,,,基因烯,,,,免疫学,,,,质谱,,,,多重组合,,,,正常化,,,,蛋白质组学,,,,QualityControl,,,,软件,,,,系统生物学 |
版本 | 1.2.7 |
在生物导体中 | Bioc 3.8(R-3.5)(1年) |
执照 | GPL(> = 3) +文件许可证 |
要看 | R(> = 3.6.0) |
进口 | AnnotationDbi,,,,Biomart,,,,位64,,,,循环,,,,簇,,,,复杂的图像,,,,Corrplot,,,,Data.Table,,,,dplyr,,,,事实,,,,Factominer,,,,getopt,,,,ggdendro,,,,GGPLOT2,,,,GPLOTS,,,,Ggrepel,,,,Gprofiler,图形,grdevices,网格,林玛,,,,MSSTATS,,,,OpenXLSX,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,表演,,,,pheatmap,,,,情节,,,,plyr,,,,rcolorbrewer,,,,秤,,,,seqinr,统计Stringr,,,,花花公子,,,,insctr,utils,Venndiagram,,,,Yaml |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/biodavidjm/artms |
BugReports | https://github.com/biodavidjm/artms/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | artms_1.2.7.tar.gz |
Windows二进制 | artms_1.2.7.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | artms_1.2.7.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/artms |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/artms |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/artms/ |
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