Biotmle

doi:10.18129/b9.bioc.biotmle

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Biotmle

有针对性的学习,具有生物标志物发现的统计数据

生物导体版本:3.9

该软件包促进了从生物测序数据(例如,微阵列,RNA-SEQ)发现的生物标志物,基于潜在的生物标志物与暴露和结果变量的关联,通过实施估计程序,该过程结合了基于目标损失的概括的概括,因果参数(例如平均治疗效应)的估计值(TMLE),其估计量在渐近线性表示(就影响函数方面)接受。

作者:Nima Hejazi [AUT,CRE,CPH],Alan Hubbard [AUT,THS],Mark van der Laan [CTB,THS],Weixin Cai [CTB]

维护者:berkeley.edu>的Nima Hejazi

引用(从r内,输入引用(“ Biotmle”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ biotmle”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Biotmle”)

html R脚本 从曝光变量中识别生物标志物
html R脚本 处理和分析RNA-seq数据
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 差异性,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,微阵列,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(2。5年)
执照 文件许可证
要看 R(> = 3.4)
进口 统计,方法,dplyr,,,,蒂布尔,,,,GGPLOT2,,,,GGSCI,,,,过热,,,,断言,,,,未来,,,,dofuture,,,,S4VECTORS,,,,生物基因,,,,生物比较,,,,总结性特征,,,,林玛,,,,TMLE
链接
建议 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,Superlearner,,,,矩阵,,,,DBI,,,,Biotmledata(> = 1.1.1)
系统要求
增强
URL https://code.nimahejazi.org/biotmle
BugReports https://github.com/nhejazi/biotmle/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 biotmle_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 biotmle_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) biotmle_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biotmle
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/biotmle
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/biotmle/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户