该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Biotmle。
生物导体版本:3.9
该软件包促进了从生物测序数据(例如,微阵列,RNA-SEQ)发现的生物标志物,基于潜在的生物标志物与暴露和结果变量的关联,通过实施估计程序,该过程结合了基于目标损失的概括的概括,因果参数(例如平均治疗效应)的估计值(TMLE),其估计量在渐近线性表示(就影响函数方面)接受。
作者:Nima Hejazi [AUT,CRE,CPH],Alan Hubbard [AUT,THS],Mark van der Laan [CTB,THS],Weixin Cai [CTB]
维护者:berkeley.edu>的Nima Hejazi
引用(从r内,输入引用(“ Biotmle”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ biotmle”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Biotmle”)
html | R脚本 | 从曝光变量中识别生物标志物 |
html | R脚本 | 处理和分析RNA-seq数据 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 差异性,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,微阵列,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.8.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(2。5年) |
执照 | 文件许可证 |
要看 | R(> = 3.4) |
进口 | 统计,方法,dplyr,,,,蒂布尔,,,,GGPLOT2,,,,GGSCI,,,,过热,,,,断言,,,,未来,,,,dofuture,,,,S4VECTORS,,,,生物基因,,,,生物比较,,,,总结性特征,,,,林玛,,,,TMLE |
链接 | |
建议 | 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,Superlearner,,,,矩阵,,,,DBI,,,,Biotmledata(> = 1.1.1) |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://code.nimahejazi.org/biotmle |
BugReports | https://github.com/nhejazi/biotmle/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | biotmle_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | biotmle_1.8.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | biotmle_1.8.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biotmle |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/biotmle |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/biotmle/ |
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