癌症

DOI:10.18129 / B9.bioc.canceR

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅癌症。

一个图形用户界面来访问和建模MSKCC的癌症基因组学数据

Bioconductor版本:3.9

包的用户友好界面基于cgdsr和其他建模方案探讨,比较和分析所有可用的癌症数据(临床数据、基因突变、基因甲基化基因表达,蛋白质磷酸化,拷贝数改变)主办的计算生物学中心朗科特林纪念医院癌症中心(MSKCC)。

作者:卡里姆Mezhoud。核安全与安全部门。核科学中心的突尼斯。

维护人员:卡里姆Mezhoud < kmezhoud gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“癌症”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GUI,GeneExpression,软件
版本	1.18.6
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.4), tcltk,tcltk2,cgdsr
进口	GSEABase,tkrplot,geNetClassifier,RUnit,公式,rpart,生存,Biobase,phenoTest,circlize,plyr、图表、数据、grDevices跑龙套
链接
建议	testthat(> = 0.10.0),R.rsp
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	canceR_1.18.6.tar.gz
Windows二进制	canceR_1.18.6.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	canceR_1.18.6.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/canceR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/癌症
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/canceR/
包下载报告	下载数据