该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅CellHTS2。
生物导体版本:3.9
该软件包提供了用于分析以微量定板格式执行的高通量测定法(包括但不限于384孔板)的工具。该功能包括数据导入和管理,归一化,质量评估,复制摘要和统计评分。提供了有关数据和分析结果的详细图形概述的网页。在我们的工作中,我们将包装应用于苍蝇和人类细胞的RNAi屏幕,以及酵母库的屏幕。简要介绍,请参阅“ CellHTS2”。
作者:Ligia Bras,Wolfgang Huber
维护者:约瑟夫·巴里(Joseph Barry)
引用(从r内,输入引用(“ CellHTS2”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ cellhts2”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ CellHTS2”)
R脚本 | 主要小插图(完整版本):基于单元的屏幕的端到端分析 | |
R脚本 | 主要小插图:基于细胞的屏幕的端到端分析 | |
R脚本 | 补充:增强剂 - 抑制器屏幕 | |
R脚本 | 补充:多通道测定 | |
参考手册 |
生物浏览 | 蜂窝基,,,,免疫学,,,,预处理,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 2.48.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.1(R-2.6)(12年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.10),rcolorbrewer,,,,生物酶, 方法,GeneFilter,,,,斑点,,,,VSN,,,,HWRITER,,,,Locfit, 网格 |
进口 | 普拉达,,,,gseabase,,,,类别,stats4,生物基因 |
链接 | |
建议 | GGPLOT2 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://www.dkfz.de/signalinghttp://www.ebi.ac.uk/huber |
取决于我 | ImageHts,,,,Starank |
进口我 | gesper,,,,HTSANALYZER,,,,rnainteract |
建议我 | 生物萨尔,,,,普拉达 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | cellhts2_2.48.0.tar.gz |
Windows二进制 | cellhts2_2.48.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | cellhts2_2.48.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellhts2 |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/cellhts2 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/cellhts2/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |