嵌合体

DOI:10.18129 / B9.bioc.chimera

此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本，请参见嵌合体．

用于聚变产物二次分析的软件包

Bioconductor版本:3.9

这个包有助于描述融合产品事件。支持从以下融合查找器中导入融合数据结果:chimeraScan、bellerophontes、导火线、FusionFinder、FusionHunter、mapSplice、tophat-fusion、FusionMap、STAR、Rsubread、fusionCatcher。

作者:Raffaele A Calogero, Matteo Carrara, Marco Beccuti, Francesca Cordero

维护者:Raffaele A Calogero < Raffaele。unit的卡洛杰罗，>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("chimera")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“嵌合体”)

PDF	R脚本	嵌合体
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施，软件
版本	1.26.0
在Bioconductor公司	BioC 2.12 (R-3.0)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase，GenomicRanges(> = 1.13.3),Rsamtools(> = 1.13.1),GenomicAlignments、方法、AnnotationDbi，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，Homo.sapiens
进口
链接
建议	BiocParallel，geneplotter
SystemRequirements	STAR, TopHat，领结和samtools是一些功能所必需的
增强了	Rsubread，BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene，BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene，Mus.musculus，BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	chimera_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	chimera_1.26.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	chimera_1.26.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chimera
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/chimera
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/chimera/
软件包下载报告	下载数据