clusterSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.clusterSeq

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见clusterSeq

通过识别共表达模式对高通量测序数据进行聚类

Bioconductor版本:3.9

基于它们在多个(复制的)生物样本上的表达来鉴定共表达基因簇。

作者:Thomas J. Hardcastle & Irene Papatheodorou

维护者:Thomas J. Hardcastle

引文(从R内,输入引用(“clusterSeq”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("clusterSeq")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“clusterSeq”)

PDF R脚本 高级baySeq分析
PDF 参考手册

细节

biocViews 聚类DifferentialExpressionGeneExpressionMultipleComparison测序软件
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(2.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R(>= 3.0.0),方法,BiocParallelbaySeq,图形,统计,效用
进口 BiocGenerics
链接
建议 BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 clusterSeq_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 clusterSeq_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) clusterSeq_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/clusterSeq
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/clusterSeq
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/clusterSeq/
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