警戒线

doi:10.18129/b9.bioc.cordon

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅警戒线

密码子的使用分析和基因表达的预测

生物导体版本:3.9

用于分析各种未经注释或KEGG/COG注释的DNA序列中密码子使用的工具。计算CU偏置和基于CU的基因表达性预测指标的不同度量,并对带注释的序列进行基因集富集分析。实现了可视化Cu和富集分析结果的几种方法。

作者:Anamaria Elek [Cre,Aut],Maja Kuzman [aut],Kristian Vlahovicek [aut]

维护者:gmail.com上的anamaria elek

引用(从r内,输入引用(“警戒线”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ cordon”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Cordon”)

html R脚本 警戒线
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 生物医学信息学,,,,基因表达,,,,遗传,,,,基因烯,,,,遗传学细胞生物学,,,,免疫学,,,,kegg,,,,宏基因组学,,,,途径,,,,软件,,,,可视化
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.8(R-3.5)(1年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.5)
进口 方法,统计,utils,生物弦,,,,生物酶,,,,dplyr,,,,Stringr,,,,purrr,,,,GGPLOT2,,,,Data.Table
链接
建议 生物使用,,,,测试,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/bioinfohr/cordon
BugReports https://github.com/bioinfohr/cordon/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Cordon_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 cordon_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) Cordon_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cordon
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/警戒线
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/cordon/
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