该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅警戒线。
生物导体版本:3.9
用于分析各种未经注释或KEGG/COG注释的DNA序列中密码子使用的工具。计算CU偏置和基于CU的基因表达性预测指标的不同度量,并对带注释的序列进行基因集富集分析。实现了可视化Cu和富集分析结果的几种方法。
作者:Anamaria Elek [Cre,Aut],Maja Kuzman [aut],Kristian Vlahovicek [aut]
维护者:gmail.com上的anamaria elek
引用(从r内,输入引用(“警戒线”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ cordon”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Cordon”)
html | R脚本 | 警戒线 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 生物医学信息学,,,,基因表达,,,,遗传,,,,基因烯,,,,遗传学细胞生物学,,,,免疫学,,,,kegg,,,,宏基因组学,,,,途径,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.2.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.8(R-3.5)(1年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 3.5) |
进口 | 方法,统计,utils,生物弦,,,,生物酶,,,,dplyr,,,,Stringr,,,,purrr,,,,GGPLOT2,,,,Data.Table |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,测试,,,,尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/bioinfohr/cordon |
BugReports | https://github.com/bioinfohr/cordon/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Cordon_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | cordon_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | Cordon_1.2.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cordon |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/警戒线 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/cordon/ |
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