compcoder
doi：10.18129/b9.bioc.compcoder
该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅compcoder。
RNASEQ数据模拟，差异表达分析和差异表达方法的性能比较
生物导体版本：3.9
该软件包提供了广泛的功能，用于比较通过不同方法获得的结果进行RNASEQ数据的差异表达分析。它还包含用于模拟计数数据和接口到几个软件包的函数，以执行差异表达分析。
作者：Charlotte Soneson [Aut，CRE]
维护者：charlotte soneson
引用（从r内，输入引用（“ compcoder”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ compcoder”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ compcoder”）
| R脚本 | compcoder | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，免疫学，，，，rnaseq，，，，软件 |
| 版本 | 1.20.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.14（R-3.1）（5。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 3.0.2），SM |
| 进口 | TCLTK，尼特（> = 1.2），降价，，，，rocr，，，，格子（> = 0.16），GPLOTS，，，，gtools，，，，gdata，，，，表情， 网格，克恩斯门茶，，，，大量的，，，，GGPLOT2，，，，Stringr，，，，最模式，，，，EDGER，，，，林玛，，，，vioplot， 方法 |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，EBSEQ，，，，deseq，，，，deseq2（> = 1.1.31），贝塞克（> = 2.2.0），GeneFilter，，，，Noingsq，，，，TCC，，，，NBPSEQ（> = 0.3.0） |
| 系统要求 | |
| 增强 | rpanel，，，，DSS |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | compcoder_1.20.1.tar.gz |
| Windows二进制 | compcoder_1.20.1.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | compcoder_1.20.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/compcoder |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/compcoder |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/compcoder/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
