Cosmiq

doi:10.18129/b9.bioc.cosmiq

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Cosmiq

COSMIQ-将单个质量合并为数量

生物导体版本:3.9

COSMIQ是用于预处理液态或气相色谱质谱法(LCMS/GCMS)数据的工具,重点是代谢组学或脂质组学应用程序。为了改善低丰富信号的检测,COSMIQ在应用峰值检测算法之前从所有获得的运行中生成MZ/RT空间的主图。结果是,与在每个LCMS/GCMS文件中执行峰值拾取的传统方法相比,低强度MS信号的更强大识别和量化。COSMIQ软件包构建在XCMSSET对象结构上,因此可以与软件包XCMS良好集成为替代预处理步骤。

作者:David Fischer ,Christian Panse ,endre laczko

维护者:googlemail.com上的David Fischer ,Christian Panse

引用(从r内,输入引用(“ Cosmiq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ cosmiq”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Cosmiq”)

PDF R脚本 Cosmiq底漆
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 免疫学,,,,质谱,,,,代谢组学,,,,软件
版本 1.18.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.0.2),RCPP
进口 pracma,,,,XCMS,,,,MassSpececebeet,,,,法阿科
链接
建议 运行,,,,生物基因,,,,生物使用
系统要求
增强
URL //www.andersvercelli.com/packages/devel/bioc/html/cosmiq.html
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 cosmiq_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 cosmiq_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) cosmiq_1.18.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cosmiq
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/cosmiq
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/cosmiq/
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