该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Cosmiq。
生物导体版本:3.9
COSMIQ是用于预处理液态或气相色谱质谱法(LCMS/GCMS)数据的工具,重点是代谢组学或脂质组学应用程序。为了改善低丰富信号的检测,COSMIQ在应用峰值检测算法之前从所有获得的运行中生成MZ/RT空间的主图。结果是,与在每个LCMS/GCMS文件中执行峰值拾取的传统方法相比,低强度MS信号的更强大识别和量化。COSMIQ软件包构建在XCMSSET对象结构上,因此可以与软件包XCMS良好集成为替代预处理步骤。
作者:David Fischer
维护者:googlemail.com上的David Fischer
引用(从r内,输入引用(“ Cosmiq”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ cosmiq”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Cosmiq”)
R脚本 | Cosmiq底漆 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 免疫学,,,,质谱,,,,代谢组学,,,,软件 |
版本 | 1.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.0.2),RCPP |
进口 | pracma,,,,XCMS,,,,MassSpececebeet,,,,法阿科 |
链接 | |
建议 | 运行,,,,生物基因,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | //www.andersvercelli.com/packages/devel/bioc/html/cosmiq.html |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | cosmiq_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | cosmiq_1.18.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | cosmiq_1.18.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cosmiq |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/cosmiq |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/cosmiq/ |
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