该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅ememblvep。
生物导体版本:3.9
查询通过PERL API查询Ensembl变体效应预测器。
作者:Valerie Obenchain和Lori Shepherd
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“ ememblvep”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ememblvep”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ ememblvep”)
R脚本 | ememblvep | |
R脚本 | PREV90ENSEMBLVEP | |
参考手册 | ||
文本 | 读书我 | |
文本 | 消息 |
生物浏览 | 注解,,,,SNP,,,,软件,,,,变体 |
版本 | 1.26.1 |
在生物导体中 | Bioc 2.12(R-3.0)(6。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | 方法,生物基因,,,,基因组机,,,,变体 |
进口 | S4VECTORS(> = 0.9.25),生物弦,,,,总结性特征,,,,GenomeInfodB,统计 |
链接 | |
建议 | 运行 |
系统要求 | 必须安装Ensembl VEP(API版本98)和Perl模块DBI和DBD :: MySQL。请参阅包装和ENMEMBL安装说明:http://www.ensembl.org/info/docs/tools/vep/vep/script/vep_download.html#installer |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | TVTB |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Ensemblvep_1.26.1.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | Ensemblvep_1.26.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ensemblvep |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/ememblvep |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/ensemblvep/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |