ememblvep

doi:10.18129/b9.bioc.ensemblvep

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅ememblvep

r接口到ENEMBL变体效应预测变量

生物导体版本:3.9

查询通过PERL API查询Ensembl变体效应预测器。

作者:Valerie Obenchain和Lori Shepherd

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“ ememblvep”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ememblvep”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ ememblvep”)

PDF R脚本 ememblvep
PDF R脚本 PREV90ENSEMBLVEP
PDF 参考手册
文本 读书我
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,SNP,,,,软件,,,,变体
版本 1.26.1
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(6。5年)
执照 艺术2.0
要看 方法,生物基因,,,,基因组机,,,,变体
进口 S4VECTORS(> = 0.9.25),生物弦,,,,总结性特征,,,,GenomeInfodB,统计
链接
建议 运行
系统要求 必须安装Ensembl VEP(API版本98)和Perl模块DBI和DBD :: MySQL。请参阅包装和ENMEMBL安装说明:http://www.ensembl.org/info/docs/tools/vep/vep/script/vep_download.html#installer
增强
URL
取决于我
进口我 TVTB
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Ensemblvep_1.26.1.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan) Ensemblvep_1.26.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ensemblvep
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/ememblvep
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/ensemblvep/
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