exoMepeak.

DOI：10.18129 / b9.bioc.exomepeak.

此套餐适用于Biocumonds 3.9版;对于稳定的最新版本版本，请参阅exoMepeak.。

基于Exome的Merip-SEQ数据的Anlaysis：峰值呼叫和差异分析

生物导体版本：3.9

该包装是用于分析来自MERIP-SEQ（MAA-SEQ）的亲和基于基于亲和基的ePTrAstcriptom Shortgun测序数据。它是基于exoMepeak matlab包（孟，jia等）的基于exome的exome-eNigenome测序数据的分析。“生物信息学29.12（2013）：1565-1567。）具有差异分析的新功能实验条件揭示RNA甲基胺后转录后调节中的动力学。exoMepeak R-Package接受和统计支持多种生物学重复，在内部除去PCR伪影和多映射读数，输出基于外孔的结合位点（RNA甲基化位点），并在术语中检测两个实验条件之间的差异转录RNA改性位点百分比而是绝对金额。该包仍处于积极发展，我们欢迎各种协作和通信的所有生物学和计算科学家。请随时联系贾萌博士 如果你有任何问题。

作者：林张<林先生在坎姆特·齐·Zhang>，连刘，贾萌<嘉梅在Xjtlu.edu.cn>

维护者：林张<林先生AT in cumt.edu.cn>，连刘，jia meng

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“3.6”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“exoMepeak”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“exoMepeak”）

PDF.	r script.	exoMepeak介绍
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	Highthrougputsequencing.那Methylseq.那rnaseq.那测序那软件
版本	2.17.0
在生物导体中以来	BIOC 2.13（R-3.0）（6年）
执照	GPL-2
依靠	r（> = 3.5.0），RSAMTOOLS.那基因组法（> = 1.14.5），rtracklayer.那基因管理
进口
链接到
建议
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	ExoMepeak_2.17.0.tar.gz.
Windows二进制文件	ExoMepeak_2.17.0.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	ExoMepeak_2.17.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/exomepeak.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/ exoMepeak
包短网址	https://biocumon.org/packages/exomepeak/
包裹下载报告	下载统计信息