gQTLstats

DOI:10.18129 / B9.bioc.gQTLstats

此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本,请参见gQTLstats

gQTLstats:用于eQTL和相关研究的计算效率分析

Bioconductor版本:3.9

eQTL、mQTL、dsQTL等的计算效率分析。

作者:VJ Carey

维护者:VJ Carey

引用(从R中,输入引用(“gQTLstats”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“gQTLstats”)

超文本标记语言 R脚本 gQTLstats:基因组特征的遗传学统计
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 软件
版本 1.16.0
在Bioconductor公司 BioC 3.1 (R-3.2)(4.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.1.0),Homo.sapiens
进口 方法,snpStatsBiocGenericsS4Vectors(> = 0.9.25),IRangesGenomeInfoDbGenomicFilesGenomicRangesSummarizedExperimentVariantAnnotationBiobaseBatchJobsgQTLBaselimmamgcvdplyrAnnotationDbiGenomicFeaturesggplot2reshape2doParallelforeachffbaseBBmiscbeeswarmHardyWeinberg,图形,统计,工具,闪亮的情节ermaggbeeswarm
链接
建议 geuvPackgeuvStore2RsamtoolsknitrrmarkdownggbioBiocStyleRUnitgwascatorg.Hs.eg.dbTxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGeneldblock
SystemRequirements
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建议我 gwascatldblockparglmsyriMulti
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 gQTLstats_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 gQTLstats_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) gQTLstats_1.16.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/gQTLstats
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/gQTLstats
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/gQTLstats/
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