goseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.goseq

这个包是3.9版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见goseq.

基因本体分析仪，用于RNA-seq和其他长度偏差数据

Bioconductor版本:3.9

检测基因本体和/或其他用户定义的类别，这些类别在RNA-seq数据中表示过多/不足

作者:马修·杨

维护者:Matthew Young ，纳迪亚戴维森<纳迪亚。戴维森在mcre.edu.au b>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("goseq")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“goseq”)

PDF	R脚本	goseq用户指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	去，GeneExpression，ImmunoOncology，RNASeq，测序，软件，转录
版本	1.36.0
在Bioconductor中	BioC 2.6 (R-2.11)(9.5年)
许可证	LGPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.11.0)，BiasedUrn，geneLenDataBase(> = 1.9.2)
进口	mgcv，图形，统计，utils，AnnotationDbi，GO.db，BiocGenerics
链接
建议	刨边机，org.Hs.eg.db，rtracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我	rgsepd
进口我	冠军，理想的，PathwaySplice，击杀
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	goseq_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	goseq_1.36.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	goseq_1.36.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/goseq
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/goseq
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/goseq/
软件包下载报告	下载数据