DOI:10.18129 / B9.bioc.graph

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见

graph:处理图数据结构的包

Bioconductor版本:3.9

实现一些简单图形处理功能的包。

作者:R. Gentleman, Elizabeth Whalen, W. Huber, S. Falcon

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内,输入引用(图)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("graph")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(图)

PDF R脚本 图对象的属性
PDF R脚本 clusterGraph和distGraph
PDF R脚本
PDF R脚本 图设计
PDF R脚本 graphBAM和MultiGraph类
PDF 参考手册

细节

biocViews GraphAndNetwork软件
版本 1.62.0
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 14.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 2.10),方法,BiocGenerics(> = 0.13.11)
进口 Stats, stats4, utils
链接
建议 SparseM(> = 0.36),XMLRBGLRUnit集群
SystemRequirements
增强了 Rgraphviz
URL
全靠我 apComplexbiocGraphBioMVCClass生命网络BLMACellNOptR限幅器CNORfeederEnrichmentBrowser有限元法flowMergeGOFunctionGOstatsGraphATGRridgeGSEABase超图keggorthologymaigesPackMineICANetSAMpathRenderPigengenepkgDepToolsPoTRAppiDataRbcBook1RBGLRBioinfRCyjsRDAVIDWebServiceRgraphvizROntoToolsRpsiXMLSNADataSRAdbtopGOvtpnetyeastExpData
进口我 高山AnalysisPageServerBgeeDBBiocCheckbiocGraphBiocPkgToolsbiocViews相机类别categoryComparechimeravizChIPpeakAnnoCHRONOSCytoMLDAPARDEGraphDEsubsepiNEMEventPointerExperimentHubData有限元法flowCLflowClustflowCoreflowUtilsflowWorkspaceGAPGOMGeneNetworkBuilderGOFunctionGOSimGraphAT石墨HTSanalyzeRhyperdrawKEGGgraphkeggorthologykeggorthologyMIGSAmirIntegratormnemNCIgraphNeighborNetnemnetresponseOncoSimulRontoProcopenCytoOrganismDbipathviewPCphenoPhenStatpkgDepToolsppiStatspwOmicsqpgraphRchyOptimyxRCy3RGraph2jsrsbmlRtreemixSplicingGraphs彩带ToPASeqtrackViewerVariantFiltering
建议我 AnnotationDbiBiocCaseStudiesDEGraphEBcoexpressecolitkGeneAnswersgwascatKEGGlincsMmPalateMiRNAnetbenchmarkNetPathMinerrBiopaxParserrTRMS4VectorsSPIAVariantTools
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 graph_1.62.0.tar.gz
Windows二进制 graph_1.62.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) graph_1.62.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/graph
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/graph
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/graph/
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