这个包是Bioconductor的3.9版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅htSeqTools。
Bioconductor版本:3.9
我们提供高效、易用的工具,用于高通量测序(ChIP-seq RNAseq等等)。这些包括MDS情节(PCA)类似物,检测效率低下immuno-precipitation或over-amplification工件,工具来识别和检测基因组,积累读取大的区域,和可视化的配置文件。
作者:Evarist星球,卡米尔Stephan-Otto,奥斯卡雷纳,奥斯卡弗洛雷斯,大卫Rossell
维护人员:奥斯卡雷纳<奥斯卡。雷纳在irbbarcelona.org >
从内部引用(R,回车引用(“htSeqTools”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“htSeqTools”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“htSeqTools”)
R脚本 | 手册htSeqTools图书馆 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 质量控制,测序,软件 |
版本 | 1.31.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.9 (r - 2.14)(8年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R(> = 2.12.2)、方法BiocGenerics(> = 0.1.0),Biobase,S4Vectors,IRanges、方法、质量,BSgenome,GenomeInfoDb(> = 1.1.3),GenomicRanges(> = 1.17.11) |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | 同时,多核 |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
源包 | htSeqTools_1.31.0.tar.gz |
Windows二进制 | htSeqTools_1.31.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | htSeqTools_1.31.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/htSeqTools |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ htSeqTools |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/htSeqTools/ |
包下载报告 | 下载数据 |